2020-02-06 01:58:13 +03:00
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FROM nvidia/cuda:10.0-devel-ubuntu18.04
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2020-09-10 10:13:47 +03:00
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# Temporary Installation Directory
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ENV STAGE_DIR=/tmp
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RUN mkdir -p ${STAGE_DIR}
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2020-02-06 01:58:13 +03:00
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# Installation/Basic Utilities
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RUN apt-get update && \
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2021-03-08 23:54:54 +03:00
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apt-get install -y --no-install-recommends \
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2020-09-10 20:15:20 +03:00
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software-properties-common build-essential autotools-dev \
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nfs-common pdsh \
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cmake g++ gcc \
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curl wget vim tmux emacs less unzip \
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htop iftop iotop ca-certificates openssh-client openssh-server \
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rsync iputils-ping net-tools sudo \
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llvm-9-dev
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2020-02-06 01:58:13 +03:00
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# Installation Latest Git
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RUN add-apt-repository ppa:git-core/ppa -y && \
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2021-03-08 23:54:54 +03:00
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apt-get update && \
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apt-get install -y git && \
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git --version
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2020-02-06 01:58:13 +03:00
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2020-09-10 20:15:20 +03:00
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# Client Liveness & Uncomment Port 22 for SSH Daemon
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# Keep SSH client alive from server side
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RUN echo "ClientAliveInterval 30" >> /etc/ssh/sshd_config
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RUN cp /etc/ssh/sshd_config ${STAGE_DIR}/sshd_config && \
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2021-03-08 23:54:54 +03:00
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|
sed "0,/^#Port 22/s//Port 22/" ${STAGE_DIR}/sshd_config > /etc/ssh/sshd_config
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2020-09-10 20:15:20 +03:00
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# Mellanox OFED
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ENV MLNX_OFED_VERSION=4.6-1.0.1.1
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RUN apt-get install -y libnuma-dev
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|
RUN cd ${STAGE_DIR} && \
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2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
wget -q -O - http://www.mellanox.com/downloads/ofed/MLNX_OFED-${MLNX_OFED_VERSION}/MLNX_OFED_LINUX-${MLNX_OFED_VERSION}-ubuntu18.04-x86_64.tgz | tar xzf - && \
|
|
|
|
cd MLNX_OFED_LINUX-${MLNX_OFED_VERSION}-ubuntu18.04-x86_64 && \
|
|
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|
./mlnxofedinstall --user-space-only --without-fw-update --all -q && \
|
|
|
|
cd ${STAGE_DIR} && \
|
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|
rm -rf ${STAGE_DIR}/MLNX_OFED_LINUX-${MLNX_OFED_VERSION}-ubuntu18.04-x86_64*
|
2020-09-10 20:15:20 +03:00
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# nv_peer_mem
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ENV NV_PEER_MEM_VERSION=1.1
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ENV NV_PEER_MEM_TAG=1.1-0
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|
RUN mkdir -p ${STAGE_DIR} && \
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2021-03-08 23:54:54 +03:00
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|
git clone https://github.com/Mellanox/nv_peer_memory.git --branch ${NV_PEER_MEM_TAG} ${STAGE_DIR}/nv_peer_memory && \
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cd ${STAGE_DIR}/nv_peer_memory && \
|
|
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|
./build_module.sh && \
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cd ${STAGE_DIR} && \
|
|
|
|
tar xzf ${STAGE_DIR}/nvidia-peer-memory_${NV_PEER_MEM_VERSION}.orig.tar.gz && \
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|
cd ${STAGE_DIR}/nvidia-peer-memory-${NV_PEER_MEM_VERSION} && \
|
|
|
|
apt-get update && \
|
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|
apt-get install -y dkms && \
|
|
|
|
dpkg-buildpackage -us -uc && \
|
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|
dpkg -i ${STAGE_DIR}/nvidia-peer-memory_${NV_PEER_MEM_TAG}_all.deb
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2020-09-10 20:15:20 +03:00
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2020-09-10 10:13:47 +03:00
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##############################################################################
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# OPENMPI
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##############################################################################
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ENV OPENMPI_BASEVERSION=4.0
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ENV OPENMPI_VERSION=${OPENMPI_BASEVERSION}.1
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|
RUN cd ${STAGE_DIR} && \
|
2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
wget -q -O - https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v${OPENMPI_BASEVERSION}/openmpi-${OPENMPI_VERSION}.tar.gz | tar xzf - && \
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|
cd openmpi-${OPENMPI_VERSION} && \
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|
./configure --prefix=/usr/local/openmpi-${OPENMPI_VERSION} && \
|
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make -j"$(nproc)" install && \
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ln -s /usr/local/openmpi-${OPENMPI_VERSION} /usr/local/mpi && \
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|
# Sanity check:
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test -f /usr/local/mpi/bin/mpic++ && \
|
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|
cd ${STAGE_DIR} && \
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rm -r ${STAGE_DIR}/openmpi-${OPENMPI_VERSION}
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2020-09-10 10:13:47 +03:00
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|
ENV PATH=/usr/local/mpi/bin:${PATH} \
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2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/lib:/usr/local/mpi/lib:/usr/local/mpi/lib64:${LD_LIBRARY_PATH}
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2020-09-10 10:13:47 +03:00
|
|
|
# Create a wrapper for OpenMPI to allow running as root by default
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|
RUN mv /usr/local/mpi/bin/mpirun /usr/local/mpi/bin/mpirun.real && \
|
2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
echo '#!/bin/bash' > /usr/local/mpi/bin/mpirun && \
|
|
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|
echo 'mpirun.real --allow-run-as-root --prefix /usr/local/mpi "$@"' >> /usr/local/mpi/bin/mpirun && \
|
|
|
|
chmod a+x /usr/local/mpi/bin/mpirun
|
2020-09-10 10:13:47 +03:00
|
|
|
|
2020-02-06 01:58:13 +03:00
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##############################################################################
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|
# Python
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##############################################################################
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ENV DEBIAN_FRONTEND=noninteractive
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ENV PYTHON_VERSION=3
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|
RUN apt-get install -y python3 python3-dev && \
|
2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
rm -f /usr/bin/python && \
|
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|
ln -s /usr/bin/python3 /usr/bin/python && \
|
|
|
|
curl -O https://bootstrap.pypa.io/get-pip.py && \
|
2020-02-06 01:58:13 +03:00
|
|
|
python get-pip.py && \
|
|
|
|
rm get-pip.py && \
|
2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
pip install --upgrade pip && \
|
|
|
|
# Print python an pip version
|
|
|
|
python -V && pip -V
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2020-09-02 05:16:57 +03:00
|
|
|
RUN pip install pyyaml
|
2020-09-10 20:15:20 +03:00
|
|
|
RUN pip install ipython
|
2020-02-06 01:58:13 +03:00
|
|
|
|
|
|
|
##############################################################################
|
|
|
|
# TensorFlow
|
|
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|
##############################################################################
|
2020-02-13 04:06:22 +03:00
|
|
|
ENV TENSORFLOW_VERSION=1.15.2
|
2020-02-06 01:58:13 +03:00
|
|
|
RUN pip install tensorflow-gpu==${TENSORFLOW_VERSION}
|
|
|
|
|
2020-09-10 20:15:20 +03:00
|
|
|
##############################################################################
|
|
|
|
# Some Packages
|
|
|
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##############################################################################
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|
|
RUN apt-get update && \
|
2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
apt-get install -y --no-install-recommends \
|
2020-09-10 20:15:20 +03:00
|
|
|
libsndfile-dev \
|
|
|
|
libcupti-dev \
|
|
|
|
libjpeg-dev \
|
|
|
|
libpng-dev \
|
2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
screen \
|
|
|
|
libaio-dev
|
2020-09-10 20:15:20 +03:00
|
|
|
RUN pip install psutil \
|
2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
yappi \
|
|
|
|
cffi \
|
|
|
|
ipdb \
|
|
|
|
pandas \
|
|
|
|
matplotlib \
|
|
|
|
py3nvml \
|
|
|
|
pyarrow \
|
|
|
|
graphviz \
|
|
|
|
astor \
|
|
|
|
boto3 \
|
|
|
|
tqdm \
|
|
|
|
sentencepiece \
|
|
|
|
msgpack \
|
|
|
|
requests \
|
|
|
|
pandas \
|
|
|
|
sphinx \
|
|
|
|
sphinx_rtd_theme \
|
|
|
|
scipy \
|
|
|
|
numpy \
|
|
|
|
sklearn \
|
|
|
|
scikit-learn \
|
|
|
|
nvidia-ml-py3 \
|
|
|
|
mpi4py \
|
|
|
|
cupy-cuda100
|
2020-09-10 20:15:20 +03:00
|
|
|
|
|
|
|
##############################################################################
|
|
|
|
## SSH daemon port inside container cannot conflict with host OS port
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###############################################################################
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|
ENV SSH_PORT=2222
|
|
|
|
RUN cat /etc/ssh/sshd_config > ${STAGE_DIR}/sshd_config && \
|
2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
sed "0,/^#Port 22/s//Port ${SSH_PORT}/" ${STAGE_DIR}/sshd_config > /etc/ssh/sshd_config
|
2020-09-10 20:15:20 +03:00
|
|
|
|
2020-02-06 01:58:13 +03:00
|
|
|
##############################################################################
|
|
|
|
# PyTorch
|
|
|
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##############################################################################
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|
ENV PYTORCH_VERSION=1.2.0
|
|
|
|
ENV TORCHVISION_VERSION=0.4.0
|
|
|
|
ENV TENSORBOARDX_VERSION=1.8
|
|
|
|
RUN pip install torch==${PYTORCH_VERSION}
|
|
|
|
RUN pip install torchvision==${TORCHVISION_VERSION}
|
|
|
|
RUN pip install tensorboardX==${TENSORBOARDX_VERSION}
|
|
|
|
|
|
|
|
##############################################################################
|
2020-09-10 20:15:20 +03:00
|
|
|
# PyYAML build issue
|
|
|
|
# https://stackoverflow.com/a/53926898
|
2020-02-06 01:58:13 +03:00
|
|
|
##############################################################################
|
2020-09-10 20:15:20 +03:00
|
|
|
RUN rm -rf /usr/lib/python3/dist-packages/yaml && \
|
2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
rm -rf /usr/lib/python3/dist-packages/PyYAML-*
|
2020-02-06 01:58:13 +03:00
|
|
|
|
|
|
|
##############################################################################
|
|
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|
## Add deepspeed user
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# Add a deepspeed user with user id 8877
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#RUN useradd --create-home --uid 8877 deepspeed
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|
RUN useradd --create-home --uid 1000 --shell /bin/bash deepspeed
|
|
|
|
RUN usermod -aG sudo deepspeed
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|
RUN echo "deepspeed ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL" >> /etc/sudoers
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|
# # Change to non-root privilege
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|
USER deepspeed
|
|
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##############################################################################
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|
# DeepSpeed
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2020-02-10 15:51:51 +03:00
|
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##############################################################################
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|
RUN git clone https://github.com/microsoft/DeepSpeed.git ${STAGE_DIR}/DeepSpeed
|
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|
|
RUN cd ${STAGE_DIR}/DeepSpeed && \
|
2021-03-08 23:54:54 +03:00
|
|
|
git checkout . && \
|
|
|
|
git checkout master && \
|
|
|
|
./install.sh --pip_sudo
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2020-02-10 15:51:51 +03:00
|
|
|
RUN rm -rf ${STAGE_DIR}/DeepSpeed
|
|
|
|
RUN python -c "import deepspeed; print(deepspeed.__version__)"
|